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Com projeto de arquitetura de Francisco e Manuel Aires de Mateus e programa museológico de Joaquim Boiça, o Farol Museu de Santa Marta foi reabilitado com base num protocolo firmado entre a Câmara Municipal de Cascais e o Estado Maior da Armada Portuguesa. Abriu ao público em julho de 2007, o seu modelo é inédito no país, ao conjugar espaços expositivos com a função de sinalização costeira, supervisionada pela Direção de Faróis da Marinha.

À exceção da bala de canhão encontrada em escavações arqueológicas camarárias no recinto, a coleção do Farol Museu de Santa Marta foi inteiramente restaurada e depositada no Farol Museu pela Marinha Portuguesa/Direção de Faróis.

A área expositiva divide-se em dois espaços, instalados nas antigas residências dos faroleiros.

O Núcleo 1 - Faróis Portugueses: Tecnologia e História expõe, entre outros, lentes de Fresnel de grandes dimensões, com especial destaque para o painel de aparelho ótico do Farol das Berlengas, que atinge os 3,70m de altura.

O Núcleo 2 - Santa Marta, de Forte a Farol e O Ofício de Faroleiro centra-se na vivência do Farol de Santa Marta através dos tempos. Aqui, destaca-se o diário do faroleiro, que regista minuciosamente as ocorrências de dias de nevoeiro, e noites iluminadas.

No auditório, o filme Faróis de Portugal. Cinco Séculos de História (15 minutos) conta, através do testemunho de faroleiros, o que foi a empresa de erguer e manter estes monumentos ao longo da costa portuguesa.

O visitante tem também acesso às plataformas - baterias – do antigo Forte, e à sua vista para o mar e para a Baía de Cascais.

A loja do Museu apresenta uma seleção de publicações, artigos de papelaria e objetos relacionados com as temáticas faroleira, marinha, arquitetónica e/ou cascalense.

O Serviço Educativo do Farol Museu organiza um programa abrangente destinado a públicos de todas as idades.